MICROBIAL

GENOME SEQUENCING

 微生物基因组测序

•  案例 ：微生物多样性测序与免疫抑制剂代谢
•  题目 ：Immunosuppressive effect of the gut microbiome altered byhigh- dose tacrolimus in mice.
•  杂志 ：《American Journal of Transplantation》；
•  影响因子 ：IF=6.45
•  发表日期 ：2018年6月
•  研究思路 ：本文研究比较了小鼠服用普通他克莫司剂量与连续14天服用他克莫司高剂量，对小鼠肠道菌群的变化的影响。作者利用焦磷酸测序法对微生物16S rRNA 进行扩增测序，分析测序数据并预测肠道菌群变化对身体代谢的影响。采用流式细胞仪分析血浆T细胞、肠道相关淋巴组织、引流淋巴结，研究肠道菌群与免疫功能的关系。

•  研究结果 ：

  （1）服用高剂量他克莫司改变小鼠肠道菌群的主要成分和细菌种类。与对照组相比，实验组肠道菌群中的支原体、拟杆菌属、乳酸菌属丰度显著增加，而梭菌属、瘤胃球菌属、里肯氏菌属、疣微菌属和颤螺菌属丰度显著降低。

（2）高剂量他克莫司通过改变肠道菌群影响免疫功能 与对照组相比，高剂量他克莫司组和粪便微生物转移组小鼠的调节T细胞显著增加。高剂量他克莫司组和粪便微生物转移组小鼠中IL- 2在CD4 +、CD8 +和T细胞中的表达显著低于对照组。



（3）高剂量他克莫司通过改变肠道菌群提高移植物的存活率