HUMAN

GENOME RESEQUENCING

 人基因重测序

•  案例 ：基因分型与免疫抑制剂药物代谢
•  题目 ：A donor and recipient candidate gene association study of allograft loss in renal transplant recipients receiving a tacrolimus-based regimen.
•  杂志 ：《American Journal of Transplantation》
•  影响因子 ：IF=6.45
•  发表日期 ：2018年4月
•  研究思路 ：本研究收集了法国不同移植中心，1997年至2001年的330位以及2004年至2014年的369位正常服用他克莫司的肾移植患者。利用Taqman等位基因分型法确定受体CYP3A4 rs35599367, CYP3A5 rs776746的基因型，并同时检测供体和受体ABCB1 rs1045642，ABCB1 rs1128503，ABCB1 rs2032582和 ABCB1 rs2229109的基因型。分析研究这些SNP位点的基因分型与移植肾功能失功的相关性。

•  研究结果 ：

  （1）在发现组数据中，ABCB1 c.1199 GA/AA基因型病人出现移植肾功能失功的比率显著大于ABCB1 c.1199 GG基因型病人。



（2）比较分析了回顾组中所有移植肾功能失功（2a）、其中慢性排斥引起的失功（2b）、其中急性排斥引起的失功（2c）与供体ABCB1 c.1199 G>A 基因型的相关性。研究发现供体为ABCB1 c.1199 GA/AA基因型的患者的移植肾功能失功的风险都高于供体为ABCB1 c.1199 GG基因型的患者。

•  案例 ：全基因组和目标区域捕获测序揭示DiGeorge综合症的肾功能损伤原因
•  题目 ：Genetic Drivers of Kidney Defects in the DiGeorge Syndrome
•  杂志 ：《The New England Journal of Medicine》
•  影响因子 ：79.2
•  发表日期 ：2017年2月
•  研究思路 ：DiGeorge 综合症是由于患者基因组上22q11.2区域微缺失引起的疾病，累及器官包括心脏，神经系统和肾，目前为止引起肾功能缺陷的原因一直未知。 本研究通过全基因组测序技术对2080例先天性肾脏及泌尿道异常患者和22094例对照分析，及通过全外显子组和目标区域测序技术对586例先天性肾脏异常患者分析。最终找到了22q11.2区域的一段杂合缺失与肾功能缺陷相关，并确定了致病区域的关键基因，文章同时在斑马鱼和小鼠中做了knock-out的验证实验。
•  研究结果 ：

  （1）DiGeorge 综合症中的肾功能缺陷是由于22q11.2区域370 kb区域的杂合缺失，共包含9个关键基因；



（2）在对斑马鱼和小鼠的基因knock-out验证中，模式动物表现出了相似的肾功能异常症状。