肾移植患者术后BKV感染阳性患者可达68%，其中约20%会发生BKV肾病（BKV virus nephropathy，BKVN），一旦发生BKVN，其中50%会导致移植肾的功能丧失。尿液中含有BKV基因序列和BKV感染引起的组织凋亡信号。

BKV负荷检测对预测BKVN价值低：即使BKV血症在较高时（≥4x104copies/ml），对BKVN的阳性预测值也只有41%，而BKV尿症对BKVN的阳性预测值只有27%。

血BKV检测假阴性率高：由于qPCR技术平台的限制，基于qPCR的BKV检测灵敏度不高，经常有BKVAN患者的血BKV检测为阴性。

BKVN早期诊断难：因为BKVN的A期患者一般无肾功能下降，因此较难诊断，但一旦发展到BKVN的B期以上，经积极治疗后也只有部分患者转归稳定。

肾活检具有侵入性且存在较高漏诊：由于病灶组织异质性的异质性，免疫组化和穿刺深度（是否达髓质）的影响，肾穿阴性但实际发病的比例达10-36.5%。

BKVN临床症状不典型，病理上难与BK合并排斥区分：单纯的BKV感染合并I级排斥和BKVN较难区分，而当BKVN与排斥合并存在时，对损伤的主要矛盾也难把握。