游离DNA(cell free DNA, cfDNA)指来自细胞凋亡或坏死,游离于细胞外的DNA片段,肾移植患者血液和尿液中都包含供体组织细胞凋亡来源的cfDNA。最新研究表明,供体来源cfDNA(donor-derived cfDNA, ddcfDNA)带有供体组织的基因信息,通过检测ddcfDNA可获得供体组织的健康状况,具有无创、高灵敏和实时等检测优势。
参考文献:程东瑞等.供体来源游离DNA在移植肾损伤中的研究进展[J].中华器官移植杂志(DOI:10.3760/cma.j.issn.0254-1785.2019.09)
器官移植患者血液中和尿液中的cfDNA
患者术后稳定状态下,血液和尿液中ddcfDNA的含量是相对稳定的,而对移植肾的排斥反应,会增加体液中的ddcfDNA含量。本检测基于二代基因测序平台,通过自主研发的ID-Tag seq技术*,对患者ddcfDNA进行捕获检测,结合生物信息学定量模型HQ-NIT,评估患者排斥反应的严重程度。因为移植肾损伤部位不同,引起的ddcfDNA升高情况也不同,本检测可提示急性排斥的损伤部位。另研究显示,ddcfDNA在评估排斥的治疗效果上也有作用。
*:ID-Tag seq技术通过富集cfDNA以及降低背景噪声干扰,将二代基因测序背景误差下降1000倍,实现超高测序深度下千分之一低频突变的高精准检出。
检测抗体介导的排斥(Antibody Mediated Rejection, AMR)时,相比供体特异性抗体(Donor Specific Antibody, DSA)等指标,ddcfDNA的阴性预测值相当(~95%),而阳性预测值更高(DSA PPV=40%,ddcfDNA PPV=90%),可减少不必要的穿刺。